הרב החל לשמש בבית ההוראה בשנת תשפ”ב, וכיום משיב מטעמו בעיר נתניה. בנוסף מוסר שיעורים לבעלי בתים.
בית הוראה ‘אפיקי מים’ בראשות הגאון הגדול הרב משה פנירי שליט”א נוסד בשנת תשס”ז בשכונת רמות בירושלים. כיום משיבים מטעם בית ההוראה למעלה מ 300 רבנים, בכ -100 ערים ברחבי הארץ והעולם