הרב יגאל אלון החל את לימודיו בבית ההוראה אפיקי מים בשנת תשע"א כיום הרב ממשמש כמו"ץ בישוב תל ציון.

בנוסף הרב בעל תעודת כשיר לכהן כדיין מהרבנות הראשית לישראל משנת תשע"ג, ומכהן כדיין בדיני ממונות בכמה בתי דין, ובנוסף משמש כראש כולל ומחבר הספר משפטי הנפש - מחלות נפש לאור ההלכה. בנוסף הרב אלון עושה בוררויות, עורך צוואות אישיות והדדיות, יעוץ לדיינים ולאנשים הנזקקים לבתי הדין הרבניים ובתי דין פרטיים לממונות